Muscle cell TarBase (Homo sapiens)

From WikiPathways

Jump to: navigation, search


Contents



Curation Tags

Description

This cataloge pathway was created using the database from "http://diana.cslab.ece.ntua.gr/tarbase/" with exclusions based on evidance type. This pathway only incldes miR targeted genes expressed in Muscle cells. This pathway is meant for data mapping.

Ontology Tags

 

Bibliography

No bibliography


Categories


History

View all
CompareRevisionActionTimeUserComment
59208view19:50, 22 February 2013MaintBotUpdated Ensembl and UniProt data source
44926view10:52, 6 October 2011MartijnVanIerselOntology Term : 'muscle cell' added !
44925view10:51, 6 October 2011MartijnVanIerselOntology Term : 'miRNA pathway' added !
44274view18:09, 30 August 2011KhanspersModified categories
43676view20:48, 13 July 2011Samuel SklarModified description
43664view17:35, 13 July 2011Samuel SklarNew pathway

External references

View all 347...

Name Type Database reference
SNX19GeneProductENSG00000120451 (Ensembl)
ANAPC1GeneProductENSG00000153107 (Ensembl)
NRP1GeneProductENSG00000099250 (Ensembl)
ATAD3BGeneProductENSG00000160072 (Ensembl)
CXCL12GeneProductENSG00000107562 (Ensembl)
ATP6V0A1GeneProductENSG00000033627 (Ensembl)
NCLGeneProductENSG00000115053 (Ensembl)
CALCOCO2GeneProductENSG00000136436 (Ensembl)
ERBB2GeneProductENSG00000141736 (Ensembl)
CAPGGeneProductENSG00000042493 (Ensembl)
CPOXGeneProductENSG00000080819 (Ensembl)
CARHSP1GeneProductENSG00000153048 (Ensembl)
TH1LGeneProductENSG00000101158 (Ensembl)
CDIPTGeneProductENSG00000103502 (Ensembl)
SLC9A3R2GeneProductENSG00000065054 (Ensembl)
CDKAL1GeneProductENSG00000145996 (Ensembl)
HIPK3 GeneProductENSG00000110422 (Ensembl)
CHMP2AGeneProductENSG00000130724 (Ensembl)
TP53INP1GeneProductENSG00000164938 (Ensembl)
COMMD9GeneProductENSG00000110442 (Ensembl)
SLC7A6 GeneProductENSG00000103064 (Ensembl)
CSNK1DGeneProductENSG00000141551 (Ensembl)
GPD2GeneProductENSG00000115159 (Ensembl)
DOCK5GeneProductENSG00000147459 (Ensembl)
PWP1GeneProductENSG00000136045 (Ensembl)
FADS2GeneProductENSG00000134824 (Ensembl)
CPNE8GeneProductENSG00000139117 (Ensembl)
FAM96AGeneProductENSG00000166797 (Ensembl)
RBMS1GeneProductENSG00000153250 (Ensembl)
FNDC3AGeneProductENSG00000102531 (Ensembl)
TICAM2GeneProductENSG00000134970 (Ensembl)
GEMIN7GeneProductENSG00000142252 (Ensembl)
IGF2BP1 / IMP-1GeneProductENSG00000159217 (Ensembl)
GRPEL2GeneProductENSG00000164284 (Ensembl)
CD164GeneProductENSG00000135535 (Ensembl)
HMGA1GeneProductENSG00000137309 (Ensembl)
MAPK12 / ERK5GeneProductENSG00000188130 (Ensembl)
IFRD1GeneProductENSG00000006652 (Ensembl)
FSTL1 GeneProductENSG00000163430 (Ensembl)
IGF2BP1GeneProductENSG00000159217 (Ensembl)
FUSIP1GeneProductENSG00000188529 (Ensembl)
IPO4GeneProductENSG00000196497 (Ensembl)
USP1 GeneProductENSG00000162607 (Ensembl)
MARS2GeneProductENSG00000152428 (Ensembl)
EHMT1GeneProductENSG00000181090 (Ensembl)
MRPS24GeneProductENSG00000062582 (Ensembl)
LRRC8AGeneProductENSG00000136802 (Ensembl)
MTRRGeneProductENSG00000124275 (Ensembl)
PTBP2GeneProductENSG00000117569 (Ensembl)
NEDD4GeneProductENSG00000069869 (Ensembl)
SLC25A1GeneProductENSG00000100075 (Ensembl)
NXNGeneProductENSG00000167693 (Ensembl)
AADACL1GeneProductENSG00000144959 (Ensembl)
PGRMC1GeneProductENSG00000101856 (Ensembl)
GALNT1GeneProductENSG00000141429 (Ensembl)
POLD2GeneProductENSG00000106628 (Ensembl)
PGM1GeneProductENSG00000079739 (Ensembl)
POLR2CGeneProductENSG00000102978 (Ensembl)
SLC38A2GeneProductENSG00000134294 (Ensembl)
PPP1R7GeneProductENSG00000115685 (Ensembl)
TMED10GeneProductENSG00000170348 (Ensembl)
PXDNGeneProductENSG00000130508 (Ensembl)
TNFRSF10BGeneProductENSG00000120889 (Ensembl)
RDH10GeneProductENSG00000121039 (Ensembl)
NF2GeneProductENSG00000186575 (Ensembl)
RHOGGeneProductENSG00000177105 (Ensembl)
EZH2 / Enx-1GeneProductENSG00000106462 (Ensembl)
SCYL1GeneProductENSG00000142186 (Ensembl)
CCNG1GeneProductENSG00000113328 (Ensembl)
SLC1A4GeneProductENSG00000115902 (Ensembl)
NM_018211GeneProductENSG00000162437 (Ensembl)
SLC25A13GeneProductENSG00000004864 (Ensembl)
SRFGeneProductENSG00000112658 (Ensembl)
SLC25A24GeneProductENSG00000085491 (Ensembl)
BCL2GeneProductENSG00000171791 (Ensembl)
SLC25A32GeneProductENSG00000164933 (Ensembl)
VSNL1GeneProductENSG00000163032 (Ensembl)
SNAP23GeneProductENSG00000092531 (Ensembl)
KITGeneProductENSG00000157404 (Ensembl)
SPCS3GeneProductENSG00000129128 (Ensembl)
CYP1B1GeneProductENSG00000138061 (Ensembl)
SPRYD4GeneProductENSG00000176422 (Ensembl)
TDGGeneProductENSG00000139372 (Ensembl)
THBS1GeneProductENSG00000137801 (Ensembl)
E2F3GeneProductENSG00000112242 (Ensembl)
TTC9CGeneProductENSG00000162222 (Ensembl)
AARSD1GeneProductENSG00000108825 (Ensembl)
TYMSGeneProductENSG00000176890 (Ensembl)
CTSCGeneProductENSG00000109861 (Ensembl)
UHRF1GeneProductENSG00000034063 (Ensembl)
G6PDGeneProductENSG00000160211 (Ensembl)
VPS39GeneProductENSG00000166887 (Ensembl)
KIAA1618GeneProductENSG00000180843 (Ensembl)
COILGeneProductENSG00000121058 (Ensembl)
MRC2GeneProductENSG00000011028 (Ensembl)
GAKGeneProductENSG00000178950 (Ensembl)
POLA2GeneProductENSG00000014138 (Ensembl)
SLC38A1GeneProductENSG00000111371 (Ensembl)
PTPLAD1GeneProductENSG00000074696 (Ensembl)
SYPL1GeneProductENSG00000008282 (Ensembl)
SFXN1GeneProductENSG00000164466 (Ensembl)
TPM2GeneProductENSG00000198467 (Ensembl)
SSNA1GeneProductENSG00000176101 (Ensembl)
AMIGO2GeneProductENSG00000139211 (Ensembl)
TPM4GeneProductENSG00000167460 (Ensembl)
ANKFY1GeneProductENSG00000185722 (Ensembl)
ATRXGeneProductENSG00000085224 (Ensembl)
ATP6V1C1GeneProductENSG00000155097 (Ensembl)
ELMOD2GeneProductENSG00000179387 (Ensembl)
BET1GeneProductENSG00000105829 (Ensembl)
LMNB2GeneProductENSG00000176619 (Ensembl)
BRPF3GeneProductENSG00000096070 (Ensembl)
NUFIP2GeneProductENSG00000108256 (Ensembl)
CBFBGeneProductENSG00000067955 (Ensembl)
PPP3CAGeneProductENSG00000138814 (Ensembl)
CDK5RAP3GeneProductENSG00000108465 (Ensembl)
SEC23AGeneProductENSG00000100934 (Ensembl)
CEBPBGeneProductENSG00000172216 (Ensembl)
SLC4A7GeneProductENSG00000033867 (Ensembl)
CLDN1GeneProductENSG00000163347 (Ensembl)
STX7GeneProductENSG00000079950 (Ensembl)
CTNNB1GeneProductENSG00000168036 (Ensembl)
TMED3GeneProductENSG00000166557 (Ensembl)
CUL4BGeneProductENSG00000158290 (Ensembl)
TMEM87AGeneProductENSG00000103978 (Ensembl)
CYP51A1GeneProductENSG00000001630 (Ensembl)
WNT5AGeneProductENSG00000114251 (Ensembl)
DHX40GeneProductENSG00000108406 (Ensembl)
KRASGeneProductENSG00000133703 (Ensembl)
DNAJB1GeneProductENSG00000132002 (Ensembl)
CCND1 / Cyclin D1GeneProductENSG00000110092 (Ensembl)
DSG2GeneProductENSG00000046604 (Ensembl)
GJA1GeneProductENSG00000152661 (Ensembl)
FMNL2GeneProductENSG00000157827 (Ensembl)
ARID4B / Rbp1-likeGeneProductENSG00000054267 (Ensembl)
GNA13GeneProductENSG00000120063 (Ensembl)
NFIA / NF1-AGeneProductENSG00000162599 (Ensembl)
HSD17B12GeneProductENSG00000149084 (Ensembl)
NM_014445GeneProductENSG00000120742 (Ensembl)
HSDL1GeneProductENSG00000103160 (Ensembl)
NM_032121GeneProductENSG00000102158 (Ensembl)
LPLGeneProductENSG00000175445 (Ensembl)
CTDSP1 GeneProductENSG00000144579 (Ensembl)
LYCATGeneProductENSG00000172954 (Ensembl)
EIF2C3GeneProductENSG00000126070 (Ensembl)
METGeneProductENSG00000105976 (Ensembl)
PKM2GeneProductENSG00000067225 (Ensembl)
METTL7AGeneProductENSG00000185432 (Ensembl)
IRS1GeneProductENSG00000169047 (Ensembl)
MLSTD2GeneProductENSG00000197601 (Ensembl)
BACH1GeneProductENSG00000156273 (Ensembl)
MPZL1GeneProductENSG00000197965 (Ensembl)
E2F1GeneProductENSG00000101412 (Ensembl)
MYO10GeneProductENSG00000145555 (Ensembl)
LAMC2GeneProductENSG00000058085 (Ensembl)
MYO1EGeneProductENSG00000157483 (Ensembl)
TGFBR2GeneProductENSG00000163513 (Ensembl)
NT5EGeneProductENSG00000135318 (Ensembl)
NFIAGeneProductENSG00000162599 (Ensembl)
PDE3AGeneProductENSG00000172572 (Ensembl)
ALK4GeneProductENSG00000135503 (Ensembl)
PDLIM5GeneProductENSG00000163110 (Ensembl)
BACE1GeneProductENSG00000186318 (Ensembl)
PICALMGeneProductENSG00000073921 (Ensembl)
COL1A2 GeneProductENSG00000164692 (Ensembl)
PKN2GeneProductENSG00000065243 (Ensembl)
cyr61GeneProductENSG00000142871 (Ensembl)
PODXLGeneProductENSG00000128567 (Ensembl)
CDK6 GeneProductENSG00000105810 (Ensembl)
POLE4GeneProductENSG00000115350 (Ensembl)
C1QBP GeneProductENSG00000108561 (Ensembl)
PRKCIGeneProductENSG00000163558 (Ensembl)
"TUSC2 / Fus1 , Fusion "GeneProductENSG00000114383 (Ensembl)
PTPRJGeneProductENSG00000149177 (Ensembl)
CORO1CGeneProductENSG00000110880 (Ensembl)
RAB27BGeneProductENSG00000041353 (Ensembl)
CSRP1GeneProductENSG00000159176 (Ensembl)
RAB34GeneProductENSG00000109113 (Ensembl)
DHX15GeneProductENSG00000109606 (Ensembl)
RAB6AGeneProductENSG00000175582 (Ensembl)
EHMT2GeneProductENSG00000137324 (Ensembl)
RAI14GeneProductENSG00000039560 (Ensembl)
GNPNAT1GeneProductENSG00000100522 (Ensembl)
RCN2GeneProductENSG00000117906 (Ensembl)
ITGB4GeneProductENSG00000132470 (Ensembl)
RHEBGeneProductENSG00000106615 (Ensembl)
LRP1GeneProductENSG00000123384 (Ensembl)
SCAMP1GeneProductENSG00000085365 (Ensembl)
MOV10GeneProductENSG00000155363 (Ensembl)
SDCBPGeneProductENSG00000137575 (Ensembl)
MTHFD2GeneProductENSG00000065911 (Ensembl)
SH3BP4GeneProductENSG00000130147 (Ensembl)
PDLIM7GeneProductENSG00000196923 (Ensembl)
SNAP29GeneProductENSG00000099940 (Ensembl)
PPIBGeneProductENSG00000166794 (Ensembl)
SYNE2GeneProductENSG00000054654 (Ensembl)
PTMAGeneProductENSG00000187514 (Ensembl)
TBCAGeneProductENSG00000171530 (Ensembl)
PTPRFGeneProductENSG00000142949 (Ensembl)
TRAM1GeneProductENSG00000067167 (Ensembl)
SFRS9GeneProductENSG00000111786 (Ensembl)
TXNRD1GeneProductENSG00000198431 (Ensembl)
SH3BGRL3GeneProductENSG00000142669 (Ensembl)
UBE2J1GeneProductENSG00000198833 (Ensembl)
SNX6GeneProductENSG00000129515 (Ensembl)
WDFY1GeneProductENSG00000085449 (Ensembl)
SYNE1GeneProductENSG00000131018 (Ensembl)
ABHD10GeneProductENSG00000144827 (Ensembl)
TPM1GeneProductENSG00000140416 (Ensembl)
ACP2GeneProductENSG00000134575 (Ensembl)
YWHAQGeneProductENSG00000134308 (Ensembl)
ARHGDIAGeneProductENSG00000141522 (Ensembl)
ATP2A2GeneProductENSG00000174437 (Ensembl)
ARL2GeneProductENSG00000110025 (Ensembl)
CHD1GeneProductENSG00000153922 (Ensembl)
SNX15GeneProductENSG00000110025 (Ensembl)
DOCK7GeneProductENSG00000116641 (Ensembl)
ATG9AGeneProductENSG00000198925 (Ensembl)
FRG1GeneProductENSG00000109536 (Ensembl)
CA12GeneProductENSG00000074410 (Ensembl)
KDELC2GeneProductENSG00000178202 (Ensembl)
CACNA2D1GeneProductENSG00000153956 (Ensembl)
MBNL1GeneProductENSG00000152601 (Ensembl)
CDK5RAP1GeneProductENSG00000101391 (Ensembl)
NUCB1GeneProductENSG00000104805 (Ensembl)
CHORDC1GeneProductENSG00000110172 (Ensembl)
P4HA2GeneProductENSG00000072682 (Ensembl)
EGFRGeneProductENSG00000146648 (Ensembl)
PPP2R4GeneProductENSG00000119383 (Ensembl)
EIF4EGeneProductENSG00000151247 (Ensembl)
RAD23BGeneProductENSG00000119318 (Ensembl)
FGF2GeneProductENSG00000138685 (Ensembl)
RQCD1GeneProductENSG00000144580 (Ensembl)
FNDC3BGeneProductENSG00000075420 (Ensembl)
SLC12A4GeneProductENSG00000124067 (Ensembl)
GALNT7GeneProductENSG00000109586 (Ensembl)
SLC4A10GeneProductENSG00000144290 (Ensembl)
GFM1GeneProductENSG00000168827 (Ensembl)
SLC7A11GeneProductENSG00000151012 (Ensembl)
GFPT1GeneProductENSG00000198380 (Ensembl)
STRNGeneProductENSG00000115808 (Ensembl)
GNL3LGeneProductENSG00000130119 (Ensembl)
TLOC1GeneProductENSG00000008952 (Ensembl)
GPAMGeneProductENSG00000119927 (Ensembl)
TMED2GeneProductENSG00000086598 (Ensembl)
GSTM4GeneProductENSG00000168765 (Ensembl)
TMED7GeneProductENSG00000134970 (Ensembl)
HBXIPGeneProductENSG00000134248 (Ensembl)
TMEM41BGeneProductENSG00000166471 (Ensembl)
HMOX1GeneProductENSG00000100292 (Ensembl)
TNFAIP2GeneProductENSG00000185215 (Ensembl)
NAT6GeneProductENSG00000186792 (Ensembl)
UAP1GeneProductENSG00000117143 (Ensembl)
IFRD2GeneProductENSG00000186792 (Ensembl)
ZNF294GeneProductENSG00000198862 (Ensembl)
IGF2RGeneProductENSG00000197081 (Ensembl)
SMAD3GeneProductENSG00000166949 (Ensembl)
ITGA2GeneProductENSG00000164171 (Ensembl)
NRASGeneProductENSG00000009307 (Ensembl)
KPNA3GeneProductENSG00000102753 (Ensembl)
MTPN GeneProductENSG00000105887 (Ensembl)
LAMC1GeneProductENSG00000135862 (Ensembl)
SMC1L1GeneProductENSG00000072501 (Ensembl)
LUZP1GeneProductENSG00000169641 (Ensembl)
HDAC4GeneProductENSG00000068024 (Ensembl)
MAP2K1IP1GeneProductENSG00000109270 (Ensembl)
KCNQ1GeneProductENSG00000053918 (Ensembl)
MRPL20GeneProductENSG00000131586 (Ensembl)
RB1GeneProductENSG00000139687 (Ensembl)
NAPGGeneProductENSG00000134265 (Ensembl)
MYLIP GeneProductENSG00000007944 (Ensembl)
NARG1GeneProductENSG00000164134 (Ensembl)
CDKN1A / p21GeneProductENSG00000124762 (Ensembl)
NOTCH2GeneProductENSG00000134250 (Ensembl)
BACE1 / Beta-Secretase 1GeneProductENSG00000186318 (Ensembl)
PAFAH1B2GeneProductENSG00000168092 (Ensembl)
MAPK14GeneProductENSG00000112062 (Ensembl)
PANX1GeneProductENSG00000110218 (Ensembl)
ACAA2GeneProductENSG00000167315 (Ensembl)
PHLDB2GeneProductENSG00000144824 (Ensembl)
LAMC1 / laminin gamma GeneProductENSG00000135862 (Ensembl)
PISDGeneProductENSG00000100141 (Ensembl)
ATP6V0EGeneProductENSG00000113732 (Ensembl)
PLK1GeneProductENSG00000166851 (Ensembl)
RDH10 GeneProductENSG00000121039 (Ensembl)
PPIFGeneProductENSG00000108179 (Ensembl)
ERBB3GeneProductENSG00000065361 (Ensembl)
PSAT1GeneProductENSG00000135069 (Ensembl)
CAMTA1GeneProductENSG00000171735 (Ensembl)
RAB30GeneProductENSG00000137502 (Ensembl)
CSF1 / MCSFGeneProductENSG00000184371 (Ensembl)
RARSGeneProductENSG00000113643 (Ensembl)
ERGGeneProductENSG00000157554 (Ensembl)
RFT1GeneProductENSG00000163933 (Ensembl)
CLOCK GeneProductENSG00000134852 (Ensembl)
RTN4GeneProductENSG00000115310 (Ensembl)
MAPK7GeneProductENSG00000166484 (Ensembl)
SEC24AGeneProductENSG00000113615 (Ensembl)
DMTF1GeneProductENSG00000135164 (Ensembl)
SHOC2GeneProductENSG00000108061 (Ensembl)
MATR3GeneProductENSG00000015479 (Ensembl)
SLC12A2GeneProductENSG00000064651 (Ensembl)
TM6SF1GeneProductENSG00000136404 (Ensembl)
SLC38A5GeneProductENSG00000017483 (Ensembl)
CGI-38GeneProductENSG00000159713 (Ensembl)
SPTLC1GeneProductENSG00000090054 (Ensembl)
NCOA3 / AIB1GeneProductENSG00000124151 (Ensembl)
SRPRBGeneProductENSG00000144867 (Ensembl)
GRIA2GeneProductENSG00000120251 (Ensembl)
TMEM109GeneProductENSG00000110108 (Ensembl)
ZEB1 / TCF8GeneProductENSG00000148516 (Ensembl)
TMEM43GeneProductENSG00000170876 (Ensembl)
ESR1GeneProductENSG00000091831 (Ensembl)
TPM3GeneProductENSG00000143549 (Ensembl)
PDCD4GeneProductENSG00000150593 (Ensembl)
TXN2GeneProductENSG00000100348 (Ensembl)
"CDKN1B / KIP1, p2"GeneProductENSG00000111276 (Ensembl)
UBE4AGeneProductENSG00000110344 (Ensembl)
HES1 GeneProductENSG00000114315 (Ensembl)
ZNF622GeneProductENSG00000173545 (Ensembl)
NOTCH1 GeneProductENSG00000148400 (Ensembl)
ADARGeneProductENSG00000160710 (Ensembl)
Ezh2GeneProductENSG00000106462 (Ensembl)
ANP32BGeneProductENSG00000136938 (Ensembl)
DNMT3AGeneProductENSG00000119772 (Ensembl)
ANPEPGeneProductENSG00000166825 (Ensembl)
Mcl1GeneProductENSG00000143384 (Ensembl)
AP3B1GeneProductENSG00000132842 (Ensembl)
SPARCGeneProductENSG00000113140 (Ensembl)
AP3D1GeneProductENSG00000065000 (Ensembl)
COL1A1 GeneProductENSG00000108821 (Ensembl)
ARCN1GeneProductENSG00000095139 (Ensembl)
COL3A1 GeneProductENSG00000168542 (Ensembl)
ARF4GeneProductENSG00000168374 (Ensembl)
THBS1 GeneProductENSG00000137801 (Ensembl)
ARID1AGeneProductENSG00000117713 (Ensembl)
TMEM113 p/ ro2730GeneProductENSG00000164091 (Ensembl)
ASH2LGeneProductENSG00000129691 (Ensembl)
VEZT / vezatinGeneProductENSG00000028203 (Ensembl)
AXLGeneProductENSG00000167601 (Ensembl)
CDK6GeneProductENSG00000105810 (Ensembl)
BRWD2GeneProductENSG00000120008 (Ensembl)
ADIPOR2 GeneProductENSG00000006831 (Ensembl)
CAND1GeneProductENSG00000111530 (Ensembl)
TTKGeneProductENSG00000112742 (Ensembl)
CDCP1GeneProductENSG00000163814 (Ensembl)
ABCG2GeneProductENSG00000118777 (Ensembl)
Retrieved from "http://wikipathways.org/index.php/Pathway:WP2005"
Personal tools
Navigation